Четвертая война шиноби начинается с 256 серии. Состоялся общий сбор, произошло объединение альянса шиноби
Удзумаки Наруто, Мотои, Аоба и Киллер Би возвращаются в деревню скрытого Облака. Их сопровождает Ооноки, третий Цучикаге деревни Скрытого камня. Ооноки несёт на своих плечах Остров-черепаху вместе со своими верными телохранителями Куроцучи и Акацучи. Совет пяти Каге общим решением создает объединенные войска альянса шиноби. Войска альянса разделены на несколько отрядов, командирами которых были объявлены:
- Даруи из Скрытого Облака
- Кицучи из Скрытых Скал
- Какаши Хатаке из деревни Скрытого Листа
- Мифунэ — Даймё страны Железа
Во главе войск объединенного альянса шиноби встал Казекаге деревни Песка — Гаара. Каждому шиноби альянса был выдан протектор с одинаковой эмблемой в знак единства шиноби всех скрытых деревень.
В это же время Кабуто начинает операцию по усилению армии белого Дзетсу, используя клетки захваченного ранее капитана Ямато. Он не знал о том, что объединенный разведывательный отряд шиноби во главе с капитаном Анко уже обнаружил под землей более чем сотню тысяч клонов белого Дзетсу и поспешил доложить об этом в штаб альянса. К сожалению, Кабуто заметил присутствие разведотряда и разбил его, а капитан Анко была взята в плен.
Кабуто использует запрещенную технику нечестивого воскрешения и призывает ранее погибших членов Акацки — Итачи Учиху, Сасори, Дэйдару, Какудзу и Нагато, а также погибших джинчурики: третьего Райкаге, четвертого Казекаге— отца Гаары, второго Цучикаге, одного из семи мечников тумана — легендарного Забузу, капитана Асуму и других сильнейших ранее погибших шиноби.
Началась Четвертая Великая Война Шиноби. И Наруто Удзумаки придется принять в ней участие, ведь именно ему предначертано судьбой решить исход этой кровопролитной войны и стать величайшим шиноби в истории.