Шисуи Учиха считался одним из талантливых и сильных шиноби своего клана. Он дружил с Итачи и относится к нему как к родному брату. И именно он вдохновил Итачи на самопожертвование и защиту Родины из тени.
Шисуи был сильным человеком, преданным своему клану. Это стало причиной, по которой его использовали в качестве шпиона. Руководство Конохи боялось, что Учихи пожелают получить больше власти и развяжет гражданскую войну. Чтобы предотвратить подобное, Шисуи получил приказ следить за кланом и, в частности, Итачи.
Шисуи был нетипичным представителем Учих, так как даже после пробуждения Шарингана и Мангекё Шарингана он сумел противостоять Проклятию Ненависти. Он пробудил Мангекё во время Третьей Мировой Войны, когда увидел смерть лучшего своими глазами. Проклятье Ненависти настигает тех Учих, которые теряют близких людей и начинают мстить за них. Как однажды верно подметил Тобирама Сенджу, второй Хокаге и брат Хаширамы, клан Учиха очень ценит дружбу и семью; поэтому в случае потери близкого человека они способны обратить свою любовь в ненависть и сделать всё возможное для осуществление мести. Проклятье Ненависти настигло Индру (предок Учих), Саске, Обито и даже Мадару. От этого Проклятья почти невозможно избавиться, Хашираме удалось лишь на время наставить своего друга Мадару на правильный путь, однако тот всё равно вернулся к осуществлению своих жестоких планов по захвату мира. И только Наруто Удзумаки сумел спасти своего друга Саске.
Шисуи до последнего оставался верен Воле Огня (как и Итачи), поэтому он не поддался негативным настроениям своей семьи и остался преданным и деревне, и всем её жителям. Когда возникла угроза государственного переворота со стороны Учих, руководство деревни приняло решение, согласно которому Шисуи предстояло с помощью своего глаза и техники Котоамацуками взять на время под контроль разум Фугаку (отец Саске и глава Полиции Конохи) и без шума подавит идею революции.
Однако Данзо не верил Шисуи и считал, что тот будет сам манипулировать главой клана, и эти действия не приведут к разрешению конфликта в деревне. Тогда он захотел отнять шаринганы Шисуи для усиления своей власти. Учихе всё-таки удалось спастись от людей Данзо, но один его глаз уже был потерян. Тогда он оставил свой правый глаз своему лучшему другу Итачи и попросил его защищать Коноху и честное имя их клана. После этого Шисуи с улыбкой на лице прыгнул со скалы. Смерть друга помогла пробудить Итачи свой Мангекё. Эти действия произошли это в 358 серии второго сезона.