Обито был вытащен из-под завала скрывающимся от всех Мадарой. Раздавленная часть была заменена белым Дзецу, поэтому Обито оказался вновь в состоянии сражаться. При первом случае он сбежал из убежища Мадары, когда узнал, что Рин грозит опасность. Но он не успевает прийти во время. Он видит смерть Рин от рук Какаши. В этот момент у него пробуждается Мангеке Шаринган и он уничтожает всех противников.
После этого он возвращается в логово, и Мадара представляет ему свой план Вечного Цукуеми. Обито понравился план, и он согласился продолжить его осуществление после смерти Мадары.
Он находит Нагато, которому Мадара однажды пересадил свой Риннеган и убеждает создать организацию по поиску хвостатых. Сам Обито взял себе имя Тоби и скрыл за маской свое лицо. Долгое время оставаясь в тени, он появляется в Акацуки взамен погибшего Сасори. Не играя там значительной роли, он использовал свое положение лишь для контроля. Решив, что время пришло, он находит тело Нагато, и забирает риннеган Мадары.
Тогда план переходит в финальную стадию. Обито становится биджу Десятихвостого. Но проблема заключается в том, что ему нужно воскресить Мадару с помощью риннегана. Мадара, хотя и приведенный в жизнь с помощью Кабуто, не является полностью живым, и не может воплотить план в таком состоянии.
Наруто удается убедить Обито перейти на их сторону. Он показывает, как они похожи друг на друга. Обито так же, как и наруто, хотел стать Хокаге. И иллюзия, порожденная Вечным Цукуеми не сможет заменить рельный мир.
Когда появляется Кагуя, Обито присоединяется к команде, и помогает уничтожить Кагую. Он погибает, когда спасает Какаши от атаки Кагуи в 472 серии. Напоследок он отдает Какаши силу своего шарингана, и Какаши обретает технику Камуи, который постоянно пользовался Обито. Теперь Какаши в состоянии пропускать предметы через себя и даже использовать Сусано.
Как Наруто удается всех переубеждать!!!!!!!!Я чесно не понимаю!В Наруто и вправду ксть такой,так сказать талант.!